V Archivu KPR se nachází velmi rozsáhlá a zajímavá agenda udělených i neudělených milostí. Badatelé zde naleznou případy dobře známé (Slánský, Horáková) i kauzy, podle kterých byly natočeny filmy a seriály s kriminální tematikou (Metoda Markovič: Hojer, Smrt stopařek). Za pozornost stojí též spisy týkající se období okupace a spolupráce s gestapem i příběhy „obyčejných“ lidí, vyhledávané zejména genealogy. V této agendě najdeme i záležitosti trestů smrti.
Udělení milosti stvrzoval svým podpisem prezident, jak je vidět na ukázce níže. Mezi žádostmi o milost je i kauza Ctibora Nováka, bratra Zdeny Mašínové, který byl ústřední postavou vykonstruovaného procesu. V souvislosti s působením odbojové skupiny bratří Mašínů byl odsouzen k trestu smrti a 2. května 1955 popraven v Praze na Pankráci spolu s Václavem Švédou a Zbyňkem Janatou.
V současné době probíhá třídění neuspořádané části fondu z let 1949 až 1989 a vytváření jmenné databáze, která bude později sloužit jako vstupní materiál ke tvorbě inventáře. Vzhledem k enormnímu zájmu o tuto problematiku je již nyní možné zasílat badatelské dotazy na konkrétní osobnosti prostřednictvím e-mailu. Během následujícího roku je možné očekávat zveřejnění dílčích seznamů na tomto webu.
